著名肿瘤遗传学家、美国约翰斯·霍普金斯大学Vogelstein教授开发了一个基于定量蛋白组的蛋白标记物开发和个体化诊断平台,这一名为SAFE-SRM的临床蛋白组学癌症诊断平台有极高的灵敏度和更高的通量,成本更低。不受限于也不依赖蛋白抗体的特点,使SAFE-SRM能高速发现和鉴定大量新的肿瘤标志物。(Proc Natl Acad Sci U S A. 2017年12月4日在线版)
研究者认为,蛋白标志物比其他标志物更能实现肿瘤早诊,蛋白诊断有望提供肿瘤早诊的有用信息。一个细胞有一套基因组,肿瘤细胞也只有一个或几个拷贝的突变基因,而一个细胞在其生命周期中,表达几百万、上千万甚至更多拷贝数量的肿瘤相关蛋白,还不包括肿瘤细胞所处微环境对肿瘤细胞做出反应而表达蛋白。研究者曾对单个肿瘤细胞中KRAS蛋白表达量进行了定量,发现单个肿瘤细胞同一时间内平均含有130万个K-ras蛋白,但只有1个拷贝DNA分子含KRAS基因突变。
只有当肿瘤细胞死亡时,才将存储在细胞核基因组DNA中的突变基因信息及遗传信息释放到外周血中。在细胞死亡之前就大量表达的蛋白实际上是肿瘤早诊的更有潜力的靶标,可帮助我们更早实现疾病筛检和干预。研究者认为,基于临床蛋白组学的肿瘤早诊会是未来的研究热点,将有巨大的临床应用潜力。
研究者指出,传统依赖于抗原-抗体反应的检测方法对蛋白抗原的完整程度有很高的要求,如果蛋白在血液中被蛋白酶部分降解破坏,或在其他酶作用下发生了修饰,那么传统的依赖于抗体的检测方法是不能成功检出该蛋白的。研究者采用的新技术克服了令蛋白组学领域长期困扰的灵敏度低和重复性差的两大难题,可谓将人类蛋白组学研究向前推进了一大步,也彰显了蛋白组学在临床应用潜力。
研究者发现了用于卵巢癌早诊的新的蛋白标志物肽基脯氨酰异构酶A(peptidylprolyl isomerase A),这一标志物能准确检出CA125(目前广泛应用的卵巢癌诊断标志物)阴性的卵巢癌患者,且未误检任何健康样本,特异性为100%。这一发现对卵巢癌早诊有重大意义,有望提高女性卵巢癌的无进展生存率和生存期。
Vogelstein教授是享誉世界的肿瘤遗传学家,也是癌症基因组和癌症诊断专家,是P53、APC等众多抑癌基因的发现者和功能阐述者。
转自:全球肿瘤快讯