一项新研究表明健康食管皮肤组织中的细胞随着年龄的增长可能会逐渐发生与癌症相关的突变,Wellcome Trust Sanger研究所的研究员,高级作者Philip Jones在一份声明中说,半数以上中年人的组织中检测到较多的突变体。
来自桑格研究所和剑桥大学的Jones和他的同事对数十种癌症基因进行了超深度靶向测序,这些样本来自于9名年龄在20岁到75岁之间的器官移植捐赠者。他们的研究结果显示,随着个体年龄的增长,这些基因的体细胞突变增多,同时对14个被评估基因突变的细胞克隆进行了阳性选择。这项研究今天在线发表在《科学》 杂志上,之前我们对正常组织中的体细胞进化知之甚少,这项研究有助于深入了解癌症和衰老的起源。
研究小组指出,正常食管组织中的NOTCH1基因突变情况尤为突出,超过了食管癌样本中描述的NOTCH1突变率。共同第一作者,桑格研究所研究员Joanna Fowler在一份声明中说,“这些结果表明,科学家可能需要根据正常组织的测序重新思考一些癌症基因的作用。”
研究人员将重点放在74个癌症基因上进行分析,在844个正常的食管上皮细胞样本中,每个样本的平均覆盖率达到了870倍。他们还进行了全基因组测序,深度平均为37倍,评估初始测序数据中包含大量克隆群体的21个样本。该团队利用其分析算法发现了超过8,900个体细胞突变和6,935个独立突变事件。这些变化包括与中年个体样本中正常阳光暴露皮肤中描述的相比更多的癌症相关变异。在阳性选择的14个反复突变基因中,研究人员指出,11个基因以前被归类为食管鳞状细胞癌驱动因子。仅在NOTCH1中,他们鉴定了2,055种不同的编码突变,其中大多数是非同义的。除了食管中体细胞突变的年龄相关性上升之外,研究小组还指出突变选择强度似乎因个体而异。
通过分析全基因组数据,该小组了解了组织中存在的突变特征,为可能产生改变的诱变过程提供了潜在的线索。虽然这项工作揭示了早期癌症的发展,但它也提出了很多关于这些突变如何导致衰老和其他疾病的问题,为未来的研究开辟了有趣的途径。”
https://www.genomeweb.com/sequencing/healthy-esophageal-tissue-often-marked-cancer-related-mutations#.W8k49dczbIU