患有相同类型肿瘤的患者，有的可能会快速进展而有的可能进展缓慢。治疗效果也有很大差别，有的患者肿瘤明显缩小，而有的患者完全没有效果。在DNA，RNA或表观遗传水平上分析肿瘤有助于肿瘤学家诊断和预测癌症。
麻省理工学院和哈佛大学波士顿儿童医院和麻省理工学院进行了一项新研究，系统地检查了成神经管细胞瘤中的蛋白质修饰，研究小组首先收集了45份肿瘤样本，样本被送到Broad Institute蛋白质组学平台的团队，该团队利用Broad开发的工作流程对肿瘤蛋白质进行总体测量，以及蛋白质制成后可在细胞中进行修饰的几种方法，如作为磷酸化和乙酰化。然后，蛋白质组学计算科学家DR Mani和Karsten Krug与德国癌症研究中心合作，将这些蛋白质组学数据与DNA和RNA的总体测量结合起来。
在成神经管细胞瘤的四个现有亚组中，前两组为无翼（WNT）和声波刺猬（SHH），在第3组和第4组中，研究人员发现了新的亚型。Fraenkel和共同第一作者Tobias Ehrenberger开发了一种新方法来预测导致蛋白质组学数据变化的关键调节蛋白，这种叫做“激酶组分析”的方法使他们发现了一种蛋白质PRKDC，当灭活时，该肿瘤亚型对放射治疗更敏感。分析提示3型成神经管细胞瘤的潜在治疗途径，这种亚型具有不良预后，可能成为肿瘤细胞对辐射敏感的靶标。Fraenkel表示，“希望这项研究可以为成神经管细胞瘤患者提供更好的治疗策略，减少长期副作用。”
图片来源：CC0 Public Domain
https://medicalxpress.com/news/2018-09-protein-analysis-uncovers-cancer-subtypes.html
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