JHH外科的创始人是著名外科学家William Stewart Halsted（1852-1922），他在甲状腺、乳腺、血管和疝的外科治疗领域作出了杰出贡献，并将德国的住院医师培训制度引入美国，极大推进了美国医学事业的发展。JHH外科包括普通外科、神经外科、整形外科、耳鼻喉－头颈外科和泌尿外科。普通外科下设有心脏外科、整形外科、小儿外科、普通/ 胃肠外科、外科肿瘤学/内分泌外科、血管外科、腹部移植外科和胸外科。
JHH是美国最大的胰腺肿瘤诊疗中心之一，每年完成胰十二指肠切除手术200例以上。JHH前外科主任John L. Cameron, M.D.是世界上第一位完成1000例胰十二指肠切除术的外科医师。其胃肠、胰腺和肝胆外科（Gastrointestinal, Pancreas and Liver, Biliary Service）主任是Charles J. Yeo M.D.（现已转任托马斯杰斐逊大学Kimmel癌症中心首席外科教授），其他知名专家包括Dana Anderson、Frederic E. Eckhauser、Martin Makary等。
医院优势：
神经中心
1900年，神经外科之父Harvey Cushing在这里成功实施了第一例脑瘤手术。1937年，Walter Dandy实施了首例动脉瘤夹手术。并建立了美国首个专门的神经重症监护病房。从医院成立开始，约翰霍普金斯医院神经中心就一直致力于通过研究理解神经系统以及它对临床治疗的影响。约翰霍普金斯是最全面的神经病学中心，可诊断和治疗各种成人和儿童神经疾病。每年，门诊病人达到了30000例，并实施了4000例大脑、肿瘤、血管和外周神经手术。医院的专家享誉国际，可以为患者提供卓越的新型诊断技术和治疗方法。例如，脑肿瘤患者不仅可以接受标准的治疗，还可以接受新型治疗，包括放射、化疗、疫苗和基因疗法。约翰霍普金斯医院的死亡率是世界最低的。
癌症中心：
癌症中心成立于1973年，是世界上解密癌症机制和研发癌症新疗法方面的领导者。医院研究和治疗项目的优势在早期就受到了美国国立癌症研究院的认可，首先获得了综合癌症中心和杰出癌症中心称号。Nancy Davidson教授为美国临床肿瘤协会主席。 (William Nelson和Martin Abeloff是美国临床肿瘤协会的历任主席； Donald Coffey曾任美国癌症研究协会主席)
Stephen Baylin教授在2010年获得了癌症遗传学 NCI Alfred G. Knudson 奖。
Carol Greider教授因为发现癌症发展中端粒酶可恢复端粒并保护他们不受损伤而获得了诺贝尔生理学和医学奖。(2009)
Bert Vogelstein教授被授予美国临床肿瘤协会癌症科学奖（American Society of Clinical oncology Science of oncology Award）。(2009)
由Thomson Scientific Science Watch搜集的数据显示5名基梅尔癌症中心的研究人员是1995年到2005年癌症搜索最频繁的医生。研究人员Stephen Baylin, James Herman, Kenneth Kinzler, David Sidransky和Bert Vogelstein是肿瘤科排名前五，基梅尔癌症中心被称为癌症研究发电站，对现代科学有深远的影响。(2005)
Thomson Scientific Science Watch发现分子遗传学先驱医学博士 Bert Vogelstein是被搜索最频繁的医生，他的癌症基因研究是所有癌症研究的典范。
