近年来，医院先后获得国家卫生部2005-2007年度全国医院管理年活动先进单位、全国医院文化建设先进单位、中国医院管理协会科技创新奖、全国病历质量评比一等奖等荣誉称号，连年被评为广州市医保AAA级单位和广州市医保管理先进单位。近年来，在抗震救灾、广州亚运等突发事件和医疗保障工作中均有出色表现，分别被中共中央、国务院、中央军委授予抗震救灾英雄集体称号，被第十六届亚运会组委会、广州2011年亚残运会组委会授予广州市亚运会、亚残运会组委会先进集体称号。 　

南方医院核医学科，创建于1972年，由PET中心、SPECT显像、核素治疗、及体外放射分析等四部分组成。1985年成立核医学教研室，1986年批准为硕士学位授权点，1998年以影像医学与核医学临床二级学科批准为博士学位授权点。是一个集医疗、教学、科研于一体的现代化科室。核医学科拥有一支以教授、副教授、博士后、博士、硕士为主的优秀的专家队伍。核医学科为广东省医学会核医学分会副主任委员、中华医学会核医学分会PET学组副组长单位。

南方医院PET中心作为国家＊早建立的PET中心之一，一直把带领国内PET技术向更高、更深层次发展为已任。中心通过举办4届全国PET和PET-CT技术研讨培训班及通过接受全国十几家大医院的中高等医师来科短期培训、进修的方式，为国内PET-CT技术的发展培养了技术骨干，为带领国内PET-CT技术的发展和规范化做出了贡献。